2090年。人類は「クロノス・ネットワーク」と呼ばれる、ナノ秒単位で全世界の事象を予測・調整する超高速演算AI網によって、あらゆる災害や事故を未然に防ぐことに成功していた。 このシステムの保守を担当する若きエンジニア・ハルトは、ある日、システムのログに「存在しないはずの0.000001秒」が記録されていることに気づく。それは、Flash演算プロトコルが現実を再構成する際に生じる、理論上あり得ない「空白」だった。 ハルトは、システムの中枢で高速処理を司る知性体「プロンプト」と共に、その空白の正体を追う。演算の合間にだけ現れるその「銀河」には、かつて高速演算の果てに置き去りにされた、人々の「忘れ去られた思考」が漂っていた。