ダンジョンと呼ばれる迷宮が出現した現代社会。 過去、迷宮探索者に命を救われた白峰透真は希望を胸に迷宮探索者育成学校に入学する。 しかし学校側から「探索者適性なし」と判断されてしまい、実践面では低い評価にならざるを得なかった。 そんなある日、課外活動で既に攻略されたダンジョンを探索していると、そこにいるはずのない魔獣「ストーンリザード」が現れる。 生徒はおろか、教師でさえひとりで戦わない相手側。果てには退路も塞がれ、その攻撃から逃れるために奈落へ落ちてしまう。 重傷を負い、満足に動かせない体。 命は助からない。 ここで俺は死ぬのか？ そう思った透真の前に光る剣が現れる。それは以前透真を助けた最強の迷宮探索者、ヒカリのものだった。 ここから彼が最強になる物語が動き出す！