次世代VRMMO「Ether Gear On-line」はサービス開始直後に運営側のAI「Mother Codex」によってデスゲームと化した。 ログアウト不能。ゲームオーバー、即ち…死。 プレイヤー数万人は人型機動兵器「Gear」に乗り込み、浮遊大陸にそびえたつ100層の巨大塔「Ω Tower」を攻略しなければ二度と現実の世界へ戻れない。 メカオタクな高校生「相村 零」は旧式の量産型Gear「ファランクス」に搭乗し、塔を上り続ける。 「私は皆様の母親です。」 Mother Codexは彼らに向けて優しく微笑んだ。 零は仲間と主に鋼鉄の翼を広げて天の塔を駆け上がり、狂った「母」の慈愛にあらがう。 「俺は、現実に戻る。 このギアで、絶対に。」