天空界ヘブンは、地帝国デビルエリアに侵攻されつつあった。デビルエリアを統治する魔王サターンは、地球そのものの支配を企んでいて、人間界にもその危機が迫っていた。ヘブンの女王マリアは見習い天使のマーチに、千年前の天使軍と悪魔軍の戦いに貢献した神々の意思が導く子どもたち、通称『神様チルドレン』を捜す役目を託す。マーチは、ミカエルの援護を受けながら人間界へ向かおうとするが、途中悪魔の攻撃を受けた事で神霊箱の蓋が開いてしまい、神々の意思が人間界へと降り注いでしまう。一方、人間界では、流れ星を見ていた神田川愛奈が不思議な光に遭遇して―。