結晶化という病が蔓延した世界。
人間の文明は静かに滅びへと向かっていた。
国はわずかな希望を錬金術たちに託し、託された希望の光を灯そうと奮闘する錬金術師たち。

そんなおり。
とある錬金術師の妻が、この結晶化病に冒されてしまった。
結晶化病の治療薬作りに奔走しながらも、妻であるエマとの時間も過ごしていた主人公のロイだったが奮闘むなしくエマは結晶化で命を落としてしまう。

絶望に暮れるロイだったが、ある日。不思議な夢を見る。
それは結晶となったエマが語りかけてくる夢だ。
「エマは生きている！　まだ希望はある！」
信じない同僚たち。それでもわずかな希望を胸にロイは独りで研究を続けることになるのだった。