とある人工惑星「αメビウス」で設立された組織帝国"モノリス"は、名前の通り惑星内人類を一枚岩同然にするため、帝国主義のように他国への侵攻を続けていた。 作品の舞台はモノリスがαメビウスの全土を統一国家とした8年後であり、世間の抵抗もおさまってきた頃。 主人公はモノリス中央司令部の地下、セクター1-5で生まれた16歳の少年。 地下居住区の人々はモノリスに対抗した他国家からの移民であり、あまり優遇されていなかった。 統一化されてから8年経ち、組織として腐り初めて"一枚岩"ではなくなったモノリスの層を一つ一つ分解し、組織を正そうとする"アンモノリス"という組織に主人公は所属し、AIがロストテクノロジー化したこの惑星で8年前に失踪した父と母の行方をモノリスの内側から探る...