世界を喰らう高次元生命体『Zero』の脅威に晒される現代。次世代の守護者を育成する「国立第一異能学園」で、カイは最低ランクのEランク、名もなき「学園の清掃員」として静かな日々を送っていた。 しかし、彼には誰にも言えない秘密があった。それは、事象そのものを書き換える神の如き異能『Rewrite』の使い手であること。 彼は学園の影で『Zero』を殲滅し続けている真の英雄だが、その力を使うたびに「周囲の人間から自分の記憶が消える」という過酷な代償を負っていた。 華々しい功績は、常にSランクのエリート・シオンに奪われ、救ったはずのヒロインたちからも忘れ去られていく日々。 孤独に摩耗するカイを支えるのは、かつて彼に救われ、忘却に抗い続ける唯一の親友・リクだけだった。 記憶を奪われてもなおカイに惹かれる5人のヒロイン、増長する偽りの英雄、そして加速する『Zero』の侵食。 全てが絶望に染まる時、書き換えられた因果の果てにカイが選ぶ「幸せになるための未来」とは――。