「海域浮遊式機関」 通称「方舟」 この世界には方舟が5つ存在している。 「レカメア」「シアロ」「ラインリス」 「リアリタ」「ドニユーン」 世界は5つの機関でまわっている。 それぞれの機関には『学園』が設立されており、主人公　イロハ・ワカヨは「ドニユーン国立学園」に入学する。 そこでイコ・オクヤマという少女と出会う。