戦火をくぐり抜けた主人公(後にミチルとなる)は、孤児院へ移送される。そこで出会った赤髪の少年・ベニートとルームメイトとなる。そこでスキル〈言語士〉持ちであることが分かった2人はともに国立ベリー学園で言語文化士になるべく学ぶのであった。学園で過ごすうちにミチルとベニートはお互いにルームメイトから特別な存在へと関係を変える……