女子高生の朧 美月(おぼろ みつき)は神社の一人娘として平穏な生活を送っていた。しかし、17歳の誕生日に突如として平穏な日常が音を立てて崩れ落ちる。義兄の比護 紫郎(ひご しろう)が学校に迎えにくるのを待っているうちに転寝をすると、子供の頃から見ている不思議な夢をみる。 〈さあ、思い出せ。自分の力を…！〉 その声で目覚めると、自分が魂を喰らう「影法師」と呼ばれる異形が跋扈する異空間へと入り込んでしまっていることに気づく。義兄から言われた「何かあったら保健室を頼れ」という言葉を思い出し保健室に向かうと、待ち構えていたのは刀を持った養護教諭だった。二人で学校の外まで脱出するも、行く手を影法師に阻まれる。万事休すといったところで助けに現れたのは、右腕に黒いオーラを纏った義兄の紫郎と、大きな犬の頭を従える喫茶店のマスターだった。これを機に両親が何故植物状態になったのかを知った美月は、影法師を祓う職業「祓師(はらいし)」を目指して修行を開始する。 そして美月は、何故不思議な夢を見るのか？自分は何者なのか？影法師とは一体何なのか？敵は一体誰なのか？神話の時代から続く戦いに身を投じ、真実へと近づいていく…。