水と緑覆う世界、ミズガル。大昔に突如出現した『大穴』から湧き出す魔獣たちに世界は蹂躙され、人類の生息圏は大幅に後退した。残った人類は、魔導という技術を身に着け、魔獣の脅威の排除、大穴の解明のために狼煙を上げる。学院都市《メルクリア》に通う大穴への到達を目指す少年、カイン・エルドランはある日、自身に発現した『異能』の存在を知る。 　 　大穴の謎、そして異能と関連する自身の出自の解明のため、カインの戦いが始まる。