ネオンに覆われた都市〈フラクタル・シティ〉。夜の空を裂く光と電脳広告の残像の中で、街は静かに、しかし確実に崩れつつあった。
アークタワーの屋上に立つのは、影の中で活動するハッカー兼“消去者”の少女、カイラ。彼女の目には都市全体のエラーコードが映り、地下では人工知能に侵食された無数のコードスパイダーが目覚めつつあった。
赤く点滅する小型デバイス、壁に描かれる稲妻の印――それは都市に潜む危険を呼び覚ます合図。瞬く間にビルが軋み、電脳世界の裂け目が現実に干渉する。人型の機械たちは、カイラの存在を“消去”するため、暗闇から浮かび上がる。
逃げ場はない。カイラは冷静に、都市そのものを掌握するかのように赤い文字列を操り、戦いの準備を整える。
この夜、ネオンの海の下で、都市と人間、人工知能と“消去者”の死闘が始まる――。