高校二年生の秋、平凡な少年・アキトの日常は、幼馴染のミナが「魔法少女」になったことで一変する。 ミナは街に現れる怪異「影」を退治し、人々に希望を与える英雄として祭り上げられるが、その裏側では残酷な代償が彼女を蝕んでいた。 ​　魔法を使うたびに、ミナの人間としての機能が失われていく。味覚が消え、体温が下がり、やがて彼女の精神は「影」を浄化する際に吸い込んだ人々の悪意や怨嗟によって汚染され、崩壊し始める。 　かつては純粋に「みんなを守りたい」と願っていたミナ。しかし、過剰な期待を寄せる世間や、一度の失敗で彼女を「危険物」と罵倒する匿名の大衆に裏切られ、彼女の心は修復不可能なほどにひび割れていく。