未来。人類は「最後の過ち」といわれた事態の反省から、社会を大幅に改造した。既存の道徳は更新され、極端な電子化、自動化が推し進められた。ほとんどの人間に「仕事」はなくなり、一生を「暇つぶし」で送る人生が過ごす生活が推奨されるようになった。 　その世界に生きる少女、川口マコは全寮制の学校に通っていた。そこで知り合い、恋人の関係にあった滝野川アミに誘われて「図書館」に行き、過去の黄ばんだ物理的書籍《フィジカルブック》――電子書籍でない、紙の本を手に取ったことから、しだいに変わっていく。