1990年代以降、「アドバンス」と呼ばれる異能の少女が生まれるようになった世界。 そして一人の少女の起こした大爆発で東京は機能を停止する。 崩壊から20年。 東京は「アドバンス」とそれを利用する「東京軍」によって無法地帯と化していた。 訓練部隊を除隊した四人の少女は、かつての青春の象徴「部活動」に倣い、「便利屋コロシ部」を結成する。 部長のルナ、再生能力の凛子。 刀使いのアカネ、念動力の渚。 彼女たちの目標は東京征服。 それは囚われたルナの姉を救うための戦いでもあった。 格上チーム「極殺小隊」との死闘、 謎の少女ステラの介入、 そして明かされるルナの出自。 少女たちの青春と戦いの物語、開幕。