銀河歴1145年1月4日。銀河の果てから突如飛来した異星人WAKAーRASEによって人類は存亡の危機に直面していた。人類は未知の脅威に対して戦艦MSGKを建造。 　時は同年3月20日。異星人から太陽系を取り戻すべく、秘密裏に組織されたMSGK部隊を前線に投入するのだった。