西暦2050年、銀河辺境領域を移住可能惑星を求めて航行していたメガロード級移民船団は、資源衛星と全自動兵器生産工場を伴ったゼントラーディ基幹艦隊と遭遇、戦闘状態に。その援護に向かった新マクロス級ステルス戦闘空母「マクロスN」。そこに配属されたパイロット達の戦いと、否応無く戦争に巻き込まれた人々の、どこにでもある日常の物語。(なお、登場人物や設定等の一部を、PCｹﾞｰﾑ「マクロスsince1983」からお借りしています)