量子位相観測実験のさなか、研究員・篠塚直人は消失した。 三年後、彼は三歳児の姿で児童施設に保護される。研究所の主任研究員・御門玲子は、その子どもが自分しか知らない研究所内部の記憶を持ち、なおかつ「実験をやめろ。向こうが広がる」と警告するのを聞く。直後、研究所では観測窓が裂け、灰色の異界から侵入体が現れ、裂け目の奥には小さな子どもの影が映る。その影は、四年前の事故で死んだ芦名隼人の娘・柚葉と強く一致していた。