島の小学生はたった三人。卒業すれば学校は廃校になる。残された時間を「願い代行屋」として島民の小さな願いを叶えながら過ごしていた三人のもとに、ある日、不器用な字で書かれた依頼が届く。「この島にないものをつくって」。依頼主は、車椅子で暮らし島の外に出られない女子高生・ナギだった。コンビニもカフェもカラオケもない小さな島で、三人は島じゅうを巻き込み、廃校間近の学校を舞台にした一日限りの"ないものツアー"を決行する。ないものを数えていた少女が見つけたのは——ここにしかないものだった。