桜が変異し人体に寄生・開花する感染現象が日本列島を席巻した近未来。政府機能は北海道に移転し、人々は春眠に備えてシェルターに避難する世界。家族を札幌に疎開させ福岡に残った陸軍中佐・南田賢治は、桜前線発表の朝、妻に電話をかけ遺書の名前欄を空白にしたまま出動する。