魔王討伐から200年後、世界には平和が訪れたーはずだった。 科学技術と魔術の発展により、人口を急増させた人類はやがてその土地を巡り、相争うようになった。勇者の末裔が統治する帝国、全種族の平等をうたう連邦、民主主義を掲げる共和国、魔族と異端の抹殺を掲げる教皇領ーそして魔族の敗残兵。 銃と魔法、陰謀が飛び交う世界において、帝国魔導省対魔特異課ー影狼機関ーに所属するシューネは、ある日魔族の目撃情報を受け現場へと赴くのであった。