岡山大学の学生・久保田富貴は、考古学を本気で追究するため、自ら小さな研究サークルを立ち上げる。 仲間の澪と颯とともに、徳島県の剣山や祖谷に残る“アーク伝説”と、童謡や古代ヘブライ語の奇妙なつながりに惹かれた三人は、真相を探るため四国山中への合宿調査に挑む。 だが、それはただの学術調査では終わらず、山の奥で彼らを見つめる“何か”の気配とともに、未知の冒険へと変わっていく。