柳葉高校にゾンビが発生し、多くの生徒が取り残される。主人公武志たちは、自身の教室に拠点を確保するも、幼馴染みで彼の思い人、あかりの薬を確保するため、保健室へ向かっていた。 武志が考案した作戦でゾンビの排除には成功するが、不運が重なり一転危機に。しかしそこに現れた野球部唯一の女子、七瀬の活躍で事なきを得た。 薬の確保に成功し、教室へ戻った武志たちは、学校からの脱出がより困難になったと知り、籠城の物資を確保するため、学内の防災コンテナへと向かうことにする。リーダー気取りのバスケ部男子田口や、野球部との合流を保留にした七瀬らとともに。 傍若無人な田口のせいで危機に陥るも、武志の機転や七瀬、中嶋の活躍もあってなんとか物資を確保する。教室に戻った武志たちはつかの間、一息つくも、屋上からのゾンビの襲撃によって田口らが犠牲になり、教室を放棄せざるをえなくなる。 七瀬の提案で野球部と合流すべく部室棟へ向かう一行。そのなかで、武志は中嶋とあかりが実は両思いであることに気づいてしまう。身をひく覚悟を決めた武志。 なんとか部室棟にはたどりついたものの、そこは籠城後に発生したゾンビによって壊滅していた。自失した七瀬をかばい、武志は命がけの行動をとる。 自分をとりもどした七瀬。しかしこれ以上、学校への籠城は難しい。最後の手段は、車で学校から脱出することだ。 車の手前には、ゾンビと化した田口が立ち塞がった。全員の奮戦で田口の排除に成功し、車にたどり着いた一行だったが、七瀬が田口との戦闘中に傷を負っていたことが発覚する。七瀬は傷が田口によってつけられたものではないと主張するが、あかりのために万一があってはいけないと中嶋が七瀬の同道を拒む。 七瀬はこれを承知し、最後にと事態以前からの武志への思いを告げて去っていく。彼女の想いに気づいていなかった武志は、葛藤の末、学校へ残ることを決意し、中嶋とあかりを送り出すのだった。