かつて起こった、人と天使の戦い——《聖奏大戦》。その果てに生まれたのが、今もなお命のやり取り続く境奏界《ミューズ》である。 ――ある日、その世界の天使が日本のとある村を襲った。ごく普通の高校生として暮らしていた、由良樫 咲芽(ゆらがし さきめ)の故郷を。 それによって家族も、親友もすべて失った咲芽。しかし、刹那彼女の喉から発せられた声……突然目覚めたその力が、彼女の生きる人間界と境奏界を繋いだ。 世界を渡った彼女は、皆の仇である天使——レイヴァーを討つために強くなることを誓い、人国ガルダバルドの破天軍へと入隊。 そこで出会う人達。体感する強大な力と理不尽。そして自分自身も秘めていた――女神の喉《セレナーデ》の力について知っていくこととなる。 「咲芽――――歌って」 　一番の親友、木寺 舞（こでら まい）の放った最期の言葉を胸に、咲芽は歌を歌い続ける。遥か遠く、どこまでも届くように――――――