悪役令嬢の「断罪イベント」を制度として研究する学園――断罪アカデミー。証拠による正義を信じる令嬢レティシアは、学生たちと共に詐欺や汚職事件を調査し、断罪制度を実践していく。しかしやがて、制度の始まりが王命による政治処刑だったという歴史の闇が明らかになる。それでも彼女は断罪を続けることを選ぶ。国家の陰謀による冤罪事件を暴き、正しい断罪を示したとき、断罪は正義か国家の武器かという問いが王国に突きつけられる。