世界から「空気」が消え、万物が「音」で構成されるようになった時代。 この空の下、沈黙は「死」であり、轟音は「生命」そのものだった。 巨大な楽器を船体に冠した音響艦隊が空を焼き、人々の叫びが熱エネルギーとなる狂った戦場。 その中心を、一艘の小さな小舟がゆく。 乗っているのは、生まれつき耳の聴こえない少年――レゾ・デコード。 音の洪水に晒されながらも眉ひとつ動かさない彼は、この世界で唯一、音を「聴く」のではなく、空間に刻まれた「波形（ソースコード）」を「視る」ことができた。 数万の兵士が放つ死の合唱を、レゾは指先一つでデコード（解読）し、無害な静寂へと書き換えてしまう。 「……うるさいよ。そのノイズ（戦争）、僕が消してあげる」 彼が目指すのは、敵国・シレンツィオの最奥に聳える『沈黙の塔』。 そこには、歌えば周囲の生命を吸い取ってしまう呪い――フェルマータ（終止符）を宿すがゆえに幽閉された、孤独な王女・シエルがいた。 耳の聴こえない調律師と、歌うことを禁じられた王女。 二人の手が重なったとき、止まっていた彼女の時間（旋律）が動き出し、偽りの音に満ちた世界に「真実の色」が蘇る――。 これは、孤独な少年がその指先で世界を書き換え、最強の「楽団（ギルド）」を築き上げていく