西暦二〇五一年、東京。官幣情報省「天叢雲（アメノムラクモ）」は、ナノチップ「勾玉」によって全市民の感情を最適化し、不都合な記憶を「不要なキャッシュ」として消去する「大注連縄（おおしめなわ）計画」を完遂しようとしていた。 文脈追跡者・地代煌は、消された記憶の残滓を拾う裏稼業の最中、システムに認識されない謎の少女・美座朔楽と出会う。彼女の願いは、一枚の古い写真に写る「変わらない場所」へ行くこと。 検断官・延武誓の追跡を逃れ、二人は情報のゴミが溜まる地下深層「零号基盤（ゼロ・プラットフォーム）」へと潜る。そこには、滑らかなデジタル社会が切り捨てた、鉄錆の味と生命の摩擦が息づく「産土（うぶすな）」が眠っていた。