夜、それは「陰」と呼ばれる異形が街を支配する時間。それによって人々は夜という世界を満喫できなくなっていた。それに対抗するため存在するのが魔法少女！ 魔法を駆使し、陰を倒し、日本に再び夜を取り戻すため、彼女たちは今夜も戦う。主人公、松本菊花は魔法少女である。 昼は普通の高校生、夜は魔法少女。 彼女がいつも通りパトロールをしていたら1人の少女と会う、その出会いを皮切りに彼女は大きな事件へと身を投じていくことになる。