ある日、とある研究所から恐ろしいウイルスが流出し、世界を混乱に陥らせ、山中の村のみが生き残った。その名を、アポカリプスという。感染すれば薔薇の花びらの痣が体に浮かび、狂って暴れ、死に至る。これは、偶然生き残った娘、深命と、道で倒れていた少年、蕾徒が旅をして、その真相を突き止める物語。