１９９９年。突如、地球に蔓延したウィルスエネルギー核光子によって世界は未曽有の混乱に陥り、地上に満ちた核光子が与える害悪によって人類社会は滅びの危機に瀕した。しかし、人類は核光子を拒む都市ドームを建て、自らの生存圏を再度確立した。それから数十年後、秘密組織ウェルゲンに所属する少女春雪イブは、兄として慕っていた青年昨街明日人の行方を探していた。