2215年に第三次世界大戦が起こり，生態系を保つ事が不可能になった。 2240年、植物に選ばれた人間による種の存続を賭けた代理戦争が始まった。 木蓮に選ばれた主人公蓮見尚樹はこの戦争に巻き込まれてしまう。