膳丈院学園高校内で連続した謎の人身被害事件が発生した。 被害者はみんな学生で、全員が記憶喪失や昏睡状態、 そして現実感喪失などの症状に見舞われていた。 犯人は人の記憶を操作する異能を持った 「■■■■（クロ）」と呼ばれる存在。 たびたび五刻町で目撃されており、 その正体は謎に包まれている怪異である。 この現象に対処するため、 学園側は対処できる力を持った とある部活動に声をかけた。 その部活動の名は【特定事象研究部：S.E.I.D】─────。 堂島真中（どうじま　まなか） 恵崎幽里（えざき　ゆうり） 一ノ瀬霊遠（いちのせ　れおん） 楚楚（そそ） の４人。 果たして彼らは、 犯人を捕まえることは出来るのか！？ そして犯人の目的とは─────？？？