交通事故で家族を失い、 とある事件を起こして指名手配犯となった少年 青柳（あおやなぎ） 蛇之（へびゆき） は、孤児院で暮らしていた。 彼は本を読むことや、図鑑や植物を眺めることが好きな少年だった。尚且つ、 孤児院の友達や義妹のエメラルドと楽しく、穏やかな日々を送っていた。 しかし大晦日、蛇之とエメラルド、そして孤児院の友人4人は、突然「アーク」と呼ばれる謎の研究所へ連れて行かれる。そこで「エメラルド」以外は人体実験の被験者にされてしまう。 さらに研究員たちは、蛇之の名前を「青龍」へと改名した。 実験の末、彼らはそれぞれ特殊な“異能”を手に入れる。力を得た青龍たちは研究所内で暴走し、多くの死傷者を出した。 その後、仲間のひとり「麒麟」が持つ異能の力によって、彼らは異世界へと転移。その世界に小さな村を作り、新たな人生を始めるのだった。残念な事に「ここ」も平和ではなかった。