日本各地に広がる、敵(ネフィリム)の攻撃から街を守るのは、かつて歴史に名を刻み込んだ、偉人たちの子孫であり、偉人たちの能力を引き継ぐ、エスパーと呼ばれるものたち。 エスパー組織に所属する翔はチームメイトの椛、澪、北斗たちと共に、上層部からある重大な依頼を受ける。 そしてこの依頼は、エスパーの真相に迫る、衝撃の事実が隠されたものだった。