2087年のネオ新宿。魔法と電脳技術が融合した世界で、情報屋の九条灰慈は裏社会の依頼をこなして日銭を稼ぐ。ある日「消えた天才魔術師を探せ」という依頼を受けるが、調査を進めるうちに都市の電脳インフラを支える「中枢魔術回路」に致命的なバグが仕込まれていることを知る。消えた魔術師はそのバグに気づいた者だった。巨大企業・反政府組織・電脳警察の三つ巴の中で、灰慈は自分の流儀を貫きながら真実に辿り着く。