核戦争から250年後。魔界公国と帝国の長き戦争の最中、辺境村ムカイハラの少年ソウマは、公国軍の突然の襲撃で父と故郷を失う。父から託された守護魔導書により、銀色の魔導鎧「シロガラス」に覚醒したソウマは、帝国の輸送艦「テツカガミ」で仲間たちと共に逃亡しながら、公国エース・レイ率いる魔導騎兵部隊と死闘を繰り広げる。失われたすべてを取り戻すため、少年は守護者としての運命を継ぎ、魔界独立戦争の渦に身を投じる——。