西暦2028年、東京。 三辻坂の夜を震撼させる『連続辻斬り事件』に頭を悩ませる高校生／草薙カイリは、謎の転校生との出会いを契機に、己に与えられた運命を知る。 街を蝕むは『魔剣病』。狂気への失墜者に凶器を与える精神疾患にして流行り病。 新種の奇病と相対するは、現代唯一の魔法たる『魔弾』の使い手たち。 魔剣と魔弾が交錯する夜は、薄皮一枚隔てた先に。 玉座を攫え、簒奪の魔剣。 禁忌を謳え、宿痾の剣鬼。 魔剣・簒奪魔皇。 魔剣病を狩る真の魔剣が、闇に病んだ東京の夜を斬る―――。