寝たら死に至る病を引き起こす「オンディーヌウイルス」。全世界の人間が感染し、99.999%が死亡した。親父に無理やりシェルターに入れられ生き残った隼人。親父の同僚という毒島。二人が生き残る道を探すため、つくばへ向かう。