全国民がサムライの鎧を纏った国、日本。 攻められない「逆鎖国」が、今、再び動き出す。 八咫学院の入学式で、木の匂いと斜光の中で出会った三人の若き魂—— 純粋に師祖の思想を信じる天野光、整合性を求める鈴木詩織、護ることを誓う佐藤英男。 彼らの友情は、国際プロジェクトという大波の中で試されていく。 古の祈りを継ぐ巫女の影と、相互尊重の光。 師祖・藤林匠の道を継ぐ者たちと、論理の刃を振るうもう一つの思想。 そして、心の鞘となるAI「MIYABI」と、その対極に立つ存在。 世界が、初めて泣く日。 祈りが、壁になる。 守り抜くことこそが勝利—— その静かな真理が、三つの魂を、それぞれの深淵へと導いていく。 第一部【瑞の系譜】、ここに開幕。