首都圏沖に現れた反乱潜水艦。撃てば国が傷つき、撃たなければ首都が脅かされる。 そんな最悪の国家危機に送り込まれたのは、内閣直轄の非公式執行官・如月静流――少女の姿をした、国家機密級の処理者だった。