潔癖症の真木悠樹は、人と触れ合うことができない男子生徒だった。そのため、友人もできず、大好きなミステリー小説を読み耽る日々を送っていた。 そんなある日、悠樹は偶然にも学年一の美少女、鏡宮愛莉と文字通り『手が触れ合って』しまう。嫌悪の念を抱いた悠樹は、すぐに手を洗う行動を取る。しかし、愛莉にその光景を目撃されてしまう。 愛莉にとっては、誰からも好かれるはずの自分に触れて手を洗う男の存在などあり得なかった。屈辱なのかどうかよくわからない感情に支配された愛莉は、悠樹に執着するようになる。 同時に、別のクラスでは、一人の女子生徒が行方不明になる事件が発生していた。 潔癖症の少年と、高慢な学校一の美少女という凸凹コンビがバディを組んで事件を解決する学園推理の物語がここに始まる。