地球各地に突如出現したワームホール。そこから侵入するモンスターから人類を守るのは、選ばれし覚醒者たちだった。男は念力を操る戦士となり、女は圧倒的な力を誇る巨人へと変身する。人類を救うべく、覚醒者は男女の「バディ」を組み、モンスター討伐に明け暮れていた。しかし、女巨人の暴走により世界は滅亡し、陸田章斗もまた命を落とす……はずだった。 目を覚ますと、そこは地球滅亡の3年前。災禍の元凶となる女巨人・鹿野凛は、まだ覚醒していない普通の女子高生だった。再び訪れる破滅を阻止するため、回帰した章斗は凛と相棒になることを決意する。 ワームホールを次々と攻略し、快進撃でレベルアップを重ねる章斗。果たして彼は、凛の暴走を食い止め、世界滅亡の運命を書き換えることができるのか――。