永久機関の誕生を皮切りに、世界は決定的に変貌した。 無限のエネルギーを求めた研究者・技術者たちは空に浮かぶ巨大科学船団「パラドクシア」を創設し、人類史上最大の研究国家を築き上げる。 同時に世界各地では局所的な法則の歪みが発生、本来否定されたはずの学説やパラドックスの力を宿す人間「反証者」が出現し、社会は混乱へと突き進んでいった。 永久機関を生み出した男、原初の反証者は、 「この研究を完成させるには、私の人生の余白は狭すぎた」 という言葉と一冊のノートを残し、表舞台から姿を消す。 その表紙にはこう刻まれていた。 『永久機関の破壊および世界の法則の修復法』 それから数年後ーー 四元素説の反証者、アルケー・エンペイドは反証者を抹殺せんとする追手から逃走していた。 原初の反証者の失踪後、パラドクシアは「世界の法則を修復しようとする者たち」、「無限のエネルギーと技術を世界に解放しようとする者たち」、「永久機関を独占し、世界の完全な統治を目論む者たち」の三つの思想に分裂し、世界を巻き込む内乱を引き起こしていたのだ。 否定された理論の力を持つ者たちは、果たして世界の歪みか、それとも希望か。 アルケー・エンペイドは、原初の反証者が遺した答えへと歩み出す。