千葉県の過疎町・水無瀬町で、廃校となった中学校の解体工事中に白骨死体が発見された。遺体は中学生の制服を着ていたが、警察の記録には「行方不明の生徒はいない」と記されている。 湾岸タイムズの記者・成瀬澪は、その学校に在籍していた。取材を進める中で、町役場の学籍簿に「佐伯ひより」という名の生徒を見つける。在籍期間は澪と重なっているが、記憶にない。 その後、「佐伯ひより」の存在を示す様々な「証拠」が見つかる。一方、澪は、かつて不良グループに校舎の床下に連れ込まれた記憶を思い出す。