軌道上の巨大コロニー「ヘリオス・サンクチュアリ」。そこでは、太陽フレアの膨大なエネルギーを捕捉し、現実を書き換える装置――事象変異機関――が稼働していた。第一級事象操作官であり「神官」と呼ばれる科学者、朝倉理央は、人間の意志を媒介にして確率や物質、時間さえ操作する技術の習得者だった。彼女と仲間たちは、太陽の力を利用し、人類の運命や地球環境に介入する任務に挑む。科学の極限が神話と交錯する世界で、理央は人間の限界と責務に直面する。