|明治大学《めいじだいがく》考古学部の櫛名田慎一は、遺された祖父の手帳から「三つの器」と「独り神」の謎を知る。彼は考古学の知識と神話の血脈を駆使し、出雲、纏向、富士を巡り、清明と荒御の二つの道を極めながら、神代のシステムに隠された真実に迫る。古神道再興会、神祇保全局、そして高天原の保守派の思惑が交錯する中、慎一は日本神話そのものを再編する禁忌の旅に挑む。神話は過去ではない、今も続く戦いの記録である。