ある夏の日、主人公・哲平は元カノ・杏奈に呼び出されて彼女の家へ。そこで目の当たりにしたのは、かつて日本が命運を背負って宇宙へ送り出した系外惑星探査機・はつかりのプログラムだった。欠落していたそのプログラムを再送すべく、哲平と杏奈、そして杏奈の父・三治郎の3人で動き出すのだった。