最後の退魔師・桐生千夜は東京に隠棲していたが、ある雨の夜、居酒屋で再び戦いに巻き込まれる。封印「門」の鍵となる血を引く彼は、黄泉教会、協会の内通者、そして世界中に散らばる七人の鍵の継承者たちとの宿命の戦いに立ち向かう。京都で月蝕が再び訪れる時、救世か滅世か、その選択は彼の一念に懸かっている。