古代ヤマト。 大王の支配するこの国には、人知れず「影の一族」と呼ばれる者たちがいた。 天照氏。彼らは妖怪退治を専門とし、その中でもひときわ名高いのが、最強のくノ一・天照千夜である。 ある日、難しい任務の途中で、千夜は金髪のシスター・エリスと出会う。遥かローマから魔王を追ってやって来た彼女は、いまや力を失い、下級妖怪にすら太刀打ちできない状態だった。 困っているエリスを放っておけず、千夜は彼女を保護することに。 それが、日本全土を巻き込む大きな波乱の始まりだった。