世界の1/3が死んだ13年前の大災害で孤児になった主人公カヤテは普通の高校生活を送っていた。ミュージシャン、陰謀論者、政治家の活声飛び交う灰色の街中で一人の少女と出会う。笑うと花のように美しい少女は心優しい幽霊支持者だった。蔑みの眼差しを向ける世間とは反対に、幽霊とも分け隔てなく接する少女ソナタに興味を惹かれていく・・・